El Seminario “Cisneros” de Historia  impulsa la investigación y promoción cultural de la historia universal, con una especial atención y mirada en la historia de España y de América. Ofrece la posibilidad de encuentro e intercambio académico entre profesores e investigadores de toda la geografía española y del ámbito internacional. El Seminario es dirigido por Dr. José Luis Sánchez García, patrono de la FUE, y coordinado por Dra. Cristina del Prado Higuera. El Consejo Asesor está formado por personalidades del ámbito académico y estudiosos de esta materia, apoyando y potenciando con su trabajo distintas tareas del Seminario.

Desde 1970, el Seminario trabaja en numerosos proyectos de investigación que han dado lugar a cursos monográficos, seminarios, congresos, conferencias magistrales, presentaciones de libros, la realización de vídeos de documentación científica y a propuesta de candidatos a premios de relevancia en el ámbito de la historia. A la hora de programar las actividades del Seminario, tenemos en cuenta las efemérides de gran relieve histórico y conmemoramos aquellas que se consideran de mayor interés. Se encuentra en permanente contacto con instituciones como la Real Academia de la Historia, centros de investigación y universidades como la Universidad Católica de Valencia o la Universidad Rey Juan Carlos.

Los resultados de las investigaciones del Seminario se publican periódicamente en la colección Biografías sobre Personajes Históricos y anteriormente en la colección Tesis doctorales Cum Laude. En está última destacan, entre otras, La Monarquía Española y América. Filosofía política de la Corona según la Legislación y el pensamiento de Las Casas, Vitoria y Julián Marías, de Enrique González Fernández; Testimonios históricos y míticos de la ciudad de Suruppak Sanchiz, de Hipólito Álvarez De Toledo; La España de la posguerra: una visión a través del cine (1939-1959), de José Mendo Muñoz, y La mujer peninsular en la nueva España en el siglo XVI, de Lucas Montojo Sánchez.

La revista Cuadernos de Investigación Histórica que comenzó a editarse en 1977 de forma ininterrumpida con una periodicidad anual, se encuentra en los índices de valoración de calidad científica y editorial como SCOPUS, estando evaluada en DOAJ, ERIHPlus, el Catálogo Latindex 2.0, REDIB y CARHUS Plus+ 2018. Está indexada tanto en bases de datos multidisciplinares como en base de datos especializadas y se encuentra recogida en todas las bibliotecas universitarias adscritas a la Red REBIUN (Red de Bibliotecas Universitarias Españolas).